Le laboratoire regroupant écologistes et océanographes poursuit d'une part la tradition d'analyse des organismes et des populations planctoniques dans le réceptacle naturel qu'est la baie de Villefranche avec des méthodes d'acquisition des données modernes, d'analyse à base d' imagerie, de cultures et de modélisations. D'autre part le laboratoire utilise des techniques d'optique et de télédétection pour analyser les couleurs de l’océan et modéliser la production primaire d'organismes et d'animaux marins. Les recherches concernent également les masses d'eau des zones frontales et les apports atmosphériques et leurs impacts sur la chimie de l'oxyde de carbone, et sur la biogéochimie de l’océan.